Hoci vodné fontány pre domáce zvieratá udržiavajú cirkuláciu vody, neznamená to, že voda môže zostať nezmenená po dlhú dobu. Pri každodennom používaní sa do vody môže dostať malé množstvo slín, srsti a čiastočiek potravy z domáceho maznáčika a do nádrže sa môže usadiť aj polietavý prach. Preto sa vo všeobecnosti odporúča denne meniť vodu; mali by ste však zvýšiť frekvenciu výmeny vody na základe skutočných podmienok, napríklad počas horúceho počasia alebo keď je spotreba vody vášho domáceho maznáčika vysoká. Pri výmene vody je najlepšie vyhodiť všetku zvyšnú starú vodu a pridať čerstvú, čistú vodu, než len doplniť existujúcu vodu.

Aj samotná fontána si vyžaduje pravidelné čistenie. Pri dlhšom používaní sa v nádržke na vodu, výlevke a čerpadle môže hromadiť kožušina, vodný kameň a iné nečistoty; jednoduchá výmena vody bez čistenia zariadenia nakoniec ohrozí hygienu vody. Počas rutinnej výmeny vody môžete vykonať rýchle opláchnutie nádrže a oblasti výtoku, ale dôkladnejšie čistenie by sa malo vykonávať každých niekoľko dní, vrátane demontáže čerpadla, aby ste skontrolovali zachytenú kožušinu alebo nečistoty. Po vyčistení zaistite, aby bol všetok čistiaci prostriedok dôkladne opláchnutý a pred použitím komponenty opäť správne namontujte.

Filtračná vložka tiež vyžaduje pravidelnú údržbu; konkrétny plán výmeny závisí od pokynov k produktu, miestnej kvality vody a zvykov vášho domáceho maznáčika. Ak sa filter používa príliš dlho, môže sa v ňom nahromadiť nadmerné množstvo nečistôt, čo spôsobí zníženie účinnosti filtrácie. Ak si všimnete, že voda začne zapáchať alebo sa zakalí, alebo ak sa prietok vody výrazne zníži, mali by ste jednotku ihneď skontrolovať a vyčistiť a v prípade potreby vymeniť filter. V prípade fontán zdieľaných viacerými domácimi zvieratami sa odporúča zvýšiť frekvenciu čistenia a výmeny vody, aby sa zabezpečilo, že voda zostane čistá a bezpečná na pitie pre vašich domácich miláčikov.